How_to_registrate
如何具体实现registration 0. 心得 一开始其实根本没理解配准是具体需要做什么，只是一味的vibe coding，什么重采样，刚性配准什么的，最后生成出来的图像全是噪声，第二周感觉把这些放一起就没问题了，结果惊奇的发现人体直接错位了，锁骨来到了人体的中间地方，经过重新认真严谨思考，才意识到配准的真正含义，接下来是对具体配准过程的学习笔记。 完整代码见 GitHub：registration-scripts 1. 任务目标 当前任务是多期相 CT 图像配准。 对于同一个病例，可能存在多个期相或序列，例如： 平扫期 动脉期 门静脉期 延迟期 std5mm lung5mm 这些序列的原始 DICOM 可能存在： 切片数量不同 扫描起始位置不同 spacing 不同 origin 不同 扫描范围不同 呼吸状态导致器官位置轻微变化 因此，不能直接认为不同期相中相同编号的 DICOM 切片对应同一个身体位置。 当前目标是： 以一个期相作为 fixed image，将其他期相作为 moving image，通过配准和重采样，使不同期相在统一空间中具有一一对应的切片关系。 最终输出为 nnU-Net 多通道输入格式。 2. 大体流程 当前采用的整体流程为： 读取同一病例下的 DICOM 文件； 根据 SeriesInstanceUID 区分不同序列； 排除 localizer、scout、切片数过少、不同部位的序列； 选择一个序列作为 fixed image； 其他序列作为 moving image； 对 moving image 进行配准； 将 moving image 重采样到 fixed image 的空间； 根据共同有效扫描范围进行统一裁剪； 检查同编号切片是否对应同一部位； 保存为 nnU-Net 多通道 NIfTI 格式。 简化表示为： fixed image ↓ 提供统一空间标准 moving image ↓ 配准到 fixed image ↓ 重采样到 fixed image 空间
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